Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA10O75578 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA10O75578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms