Protein–RNA interactions for Protein: O75469

NR1I2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I2O75469 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1I2O75469 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1I2O75469 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1I2O75469 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR1I2O75469 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR1I2O75469 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1I2O75469 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms