Protein–RNA interactions for Protein: O75326

SEMA7A, Semaphorin-7A, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA7AO75326 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA7AO75326 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA7AO75326 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA7AO75326 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms