Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF11O60813 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF11O60813 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms