Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLOD3O60568 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms