Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5O60239 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP5O60239 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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SH3BP5O60239 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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SH3BP5O60239 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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SH3BP5O60239 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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SH3BP5O60239 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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