Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDIL3O43854 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDIL3O43854 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDIL3O43854 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms