Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT86O43790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT86O43790 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT86O43790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT86O43790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT86O43790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT86O43790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT86O43790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT86O43790 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT86O43790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT86O43790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT86O43790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT86O43790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT86O43790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT86O43790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT86O43790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT86O43790 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT86O43790 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT86O43790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT86O43790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT86O43790 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT86O43790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT86O43790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT86O43790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT86O43790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT86O43790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT86O43790 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT86O43790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT86O43790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT86O43790 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT86O43790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT86O43790 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT86O43790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT86O43790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT86O43790 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT86O43790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT86O43790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms