Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATCO43716 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATCO43716 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATCO43716 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATCO43716 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATCO43716 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATCO43716 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATCO43716 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATCO43716 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATCO43716 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATCO43716 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GATCO43716 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATCO43716 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATCO43716 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATCO43716 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATCO43716 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATCO43716 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATCO43716 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATCO43716 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATCO43716 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms