Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3O43617 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3O43617 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC3O43617 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms