Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBFA2T2O43439 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CBFA2T2O43439 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms