Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRXO43186 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRXO43186 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRXO43186 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRXO43186 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRXO43186 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRXO43186 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRXO43186 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRXO43186 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRXO43186 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRXO43186 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRXO43186 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRXO43186 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRXO43186 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRXO43186 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRXO43186 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRXO43186 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRXO43186 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRXO43186 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms