Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLOCKO15516 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLOCKO15516 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLOCKO15516 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms