Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD9O15198 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms