Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TO15178 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TO15178 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TO15178 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TO15178 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TO15178 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TO15178 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TO15178 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TO15178 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TO15178 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TO15178 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TO15178 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TO15178 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TO15178 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TO15178 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms