Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28O15084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD28O15084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms