Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEMP1O14524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP1O14524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP1O14524 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms