Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHDO14521 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHDO14521 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHDO14521 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHDO14521 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHDO14521 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHDO14521 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHDO14521 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHDO14521 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHDO14521 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHDO14521 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHDO14521 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHDO14521 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHDO14521 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHDO14521 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHDO14521 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms