Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE40O14503 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms