Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBAG9O00559 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms