Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN5O00501 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN5O00501 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN5O00501 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN5O00501 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN5O00501 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms