Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD2O00469 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLOD2O00469 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms