Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF4O00268 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4O00268 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4O00268 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF4O00268 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF4O00268 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF4O00268 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF4O00268 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF4O00268 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF4O00268 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF4O00268 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF4O00268 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF4O00268 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF4O00268 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF4O00268 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF4O00268 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4O00268 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4O00268 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4O00268 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4O00268 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF4O00268 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4O00268 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4O00268 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4O00268 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4O00268 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4O00268 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4O00268 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4O00268 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4O00268 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4O00268 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4O00268 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms