Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEN1O00255 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEN1O00255 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEN1O00255 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEN1O00255 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEN1O00255 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEN1O00255 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEN1O00255 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEN1O00255 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEN1O00255 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEN1O00255 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEN1O00255 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEN1O00255 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEN1O00255 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEN1O00255 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEN1O00255 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEN1O00255 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEN1O00255 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEN1O00255 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEN1O00255 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEN1O00255 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MEN1O00255 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEN1O00255 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms