Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QKU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QKU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QKU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QKU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QKU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QKU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QKU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QKU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QKU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QKU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QKU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QKU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QKU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QKU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QKU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QKU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QKU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QKU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QKU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QKU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QKU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QKU1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QKU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QKU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QKU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QKU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QKU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QKU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QKU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QKU1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QKU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms