Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCER2I3L3R5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCER2I3L3R5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms