Protein–RNA interactions for Protein: H3BPM6

MKRN2OS, MKRN2 opposite strand protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2OSH3BPM6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2OSH3BPM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2OSH3BPM6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2OSH3BPM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms