Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNH8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNH8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNH8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNH8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNH8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNH8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNH8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNH8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNH8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNH8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNH8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BNH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BNH8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNH8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNH8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNH8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNH8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNH8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNH8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNH8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNH8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNH8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNH8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNH8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNH8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNH8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNH8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms