Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP99D6REC4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP99D6REC4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP99D6REC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms