Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9J4A7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9J4A7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9J4A7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9J4A7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9J4A7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9J4A7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9J4A7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9J4A7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9J4A7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9J4A7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9J4A7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9J4A7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C9J4A7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C9J4A7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9J4A7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9J4A7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9J4A7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9J4A7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9J4A7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9J4A7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9J4A7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9J4A7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9J4A7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms