Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIIAD1A6NNX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIIAD1A6NNX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIIAD1A6NNX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms