Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85CA6NKD9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85CA6NKD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms