Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCNX2A6NKB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX2A6NKB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms