Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNDIG1LA6NDD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms