Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWA3AA6NCI4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA3AA6NCI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms