Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XIRP2A4UGR9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms