Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC144AA2RUR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC144AA2RUR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms