Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PPC1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1W2PPC1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A1W2PPC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1W2PPC1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PPC1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPC1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms