Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YXV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0J9YXV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms