Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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