Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DENND2AQ9ULE3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DENND2AQ9ULE3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms