Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms