Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX3Q9UBR4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms