Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPATA16Q9BXB7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms