Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms