Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSEN34Q9BSV6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms