Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms