Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms