Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms