Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE2Q96FN4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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